Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Abcg8Q9DBM0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg8Q9DBM0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms