Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmtr1Q9DBC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtr1Q9DBC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtr1Q9DBC3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms