Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fundc1Q9DB70 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fundc1Q9DB70 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms