Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd8Q9DA37 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd8Q9DA37 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms