Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smco2Q9DA21 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms