Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Rnf138rt1Q9D9M9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rnf138rt1Q9D9M9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rnf138rt1Q9D9M9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rnf138rt1Q9D9M9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Rnf138rt1Q9D9M9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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