Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd9Q9D9M4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdzd9Q9D9M4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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