Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp12Q9D9M2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp12Q9D9M2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp12Q9D9M2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp12Q9D9M2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp12Q9D9M2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp12Q9D9M2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp12Q9D9M2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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