Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e2Q9D902 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e2Q9D902 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms