Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi35Q9D8C4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi35Q9D8C4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifi35Q9D8C4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifi35Q9D8C4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifi35Q9D8C4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifi35Q9D8C4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifi35Q9D8C4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms