Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AplfQ9D842 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AplfQ9D842 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AplfQ9D842 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms