Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kctd4Q9D7X1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd4Q9D7X1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd4Q9D7X1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms