Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rep15Q9D7T1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rep15Q9D7T1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rep15Q9D7T1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rep15Q9D7T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rep15Q9D7T1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rep15Q9D7T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rep15Q9D7T1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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