Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Borcs8Q9D6Y4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms