Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc94Q9D6J3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms