Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm5Q9D6G9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms