Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4aQ9D6F9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb4aQ9D6F9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms