Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdr42e1Q9D665 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms