Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stag1Q9D3E6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag1Q9D3E6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms