Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vsig1Q9D2J4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsig1Q9D2J4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms