Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fndc8Q9D2H8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc8Q9D2H8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc8Q9D2H8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms