Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap5-3Q9D226 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krtap5-3Q9D226 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms