Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap57Q9D180 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap57Q9D180 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap57Q9D180 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms