Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88Q9D0N8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms