Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ribc1Q9D0B8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ribc1Q9D0B8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms