Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc47Q9D024 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms