Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm6Q9CZ69 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm6Q9CZ69 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms