Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CYI0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CYI0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CYI0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CYI0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms