Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39aQ9CYC3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms