Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Gtpbp8Q9CY28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Gtpbp8Q9CY28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Gtpbp8Q9CY28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gtpbp8Q9CY28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gtpbp8Q9CY28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtpbp8Q9CY28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gtpbp8Q9CY28 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gtpbp8Q9CY28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gtpbp8Q9CY28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gtpbp8Q9CY28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gtpbp8Q9CY28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gtpbp8Q9CY28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gtpbp8Q9CY28 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gtpbp8Q9CY28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp8Q9CY28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp8Q9CY28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp8Q9CY28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp8Q9CY28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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