Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx7Q9CY18 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx7Q9CY18 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx7Q9CY18 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms