Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl11Q9CXW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms