Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms