Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Pin4Q9CWW6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Pin4Q9CWW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin4Q9CWW6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms