Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1aQ9CU62 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms