Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrxn1Q9CS84 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Nrxn1Q9CS84 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrxn1Q9CS84 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms