Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc5Q9CRA8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms