Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pop4Q9CR08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop4Q9CR08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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