Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms