Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TpbpbQ9CQC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpbpbQ9CQC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms