Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpa3Q9CQ71 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpa3Q9CQ71 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms