Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl49Q9CQ40 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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