Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
StambpQ9CQ26 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
StambpQ9CQ26 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms