Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc18Q9CQ07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc18Q9CQ07 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc18Q9CQ07 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms