Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ska1Q9CPV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms