Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl17Q9CPR4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl17Q9CPR4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms