Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim12aQ99PQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim12aQ99PQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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