Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GpnmbQ99P91 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GpnmbQ99P91 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GpnmbQ99P91 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms