Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcg3Q99P81 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcg3Q99P81 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms