Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acss1Q99NB1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms